杭州网世协助浙江农林大学理学院高性能项目建设

一、用户简介

浙江农林大学位于杭州市临安区、杭州城西科创大走廊的西端,是浙江省重点建设高校、浙江省人民政府与国家林业和草原局共建高校。学校创建于 1958 年,2010 年更名为浙江农林大学。学院设有数学学科、统计学科、光学工程学科、化学学科 4 个学科、建有浙江省林业生物质化学利用重点实验室、浙江省物理实验教学示范中心和校级理化本科实验教学中心。

二、项目背景

学院高性能系统主要应用为计算化学方面的高性能计算工作,主要应用软件是 VASP、Gaussian、等软件。经过前期大量的测试,杭州网世了解到客户的应用对系统的需求特点,并根据需求特点设计整个系统。计算节点是承接集群的高性能计算任务的核心,具有浮点运算能力强,高性能大容量内存,低功耗,能够共同协作的特点。

三、网世产品及方案

计算节点:采用10台双路机架式服务器网世NF5280 M4,配置2E5-2680 V4处理器, 满足HPC系统对计算能力的要求。

集群存储系统:整套系统的存储空间达到 90TB 以上,充分满足了计算的需要。

管理网络:采用千兆以太网络承担集群管理监控集群的任务, 提供高可靠、高稳定、高扩展性。

计算网络:由于计算化学和材料化学计算对网络的性能要求很高,并行计算过程中,节点间通信频繁,计算中很多时间都消耗在通信过程中。通过前期的测试工作和多年来从事高性能计算的经验,对于农林大学HPC系统我们采用 56Gbps 线速 Infiniband 高速互联网络,来满足计算中对通信的需求。Infiniband 网络不但将所有的计算节点全部互联,也将存储节点和管理节点全部互联, 这样就保证了存储带宽不会形成系统的瓶颈,满足系统计算通信需求, 而且良好的模块化设计,可使系统无缝扩展。

集群调度系统:采用网世Cluster Engine, 实现集群资源的统一监控、调度、和作业管理。满足理学院集群多用户使用和管理方面的需求。

四、价值收益

网世这套 HPC集群的应用,极大地加快了理学院的研究进度,以往需要数天、甚至一个星期的运算,在集群系统中只需要几个小时就能完成,而且还能满足学院内多个科研人员的计算作业。

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